La diagnosi differenziale comprende principalmente l’esostosi subungueale e i tumori del letto ungueale (benigni e maligni). I tumori maligni da considerare sono il melanoma subungueale e il carcinoma a cellule squamose subungueali, che possono essere localmente aggressivi.
Un esame radiografico può confermare la diagnosi di esostosi subungueale.